Πλήθος μη κυβερνητικών οργανώσεων εμφανίζονται να έχουν λάβει πολύ μεγάλες χρηματοδοτήσεις από τα κονδύλια του υπουργείου Εξωτερικών. Σύμφωνα με τον έλεγχο που είχαν κάνει ορκωτοί λογιστές την περίοδο 2000 – 2010 ειχαν δοθεί πάνω από 100 εκατ. ευρώ απ’ τα κονδύλια του υπουργείου.
Σήμερα “Τα Νέα” δημοσιεύουν τη λίστα με τις κυριότερες ΜΚΟ, που χρηματοδοτήθηκαντη συγκεκριμένη περίοδο, η οποία παρατίθεται παρακάτω