Tο νέο επιχειρησιακό δόγμα του Λιμενικού αφορά, μεταξύ άλλων, την αποτελεσματικότερη αντιμετώπιση της παράνομης μετανάστευσης, της παράνομης αλιείας, την αστυνόμευση των θαλάσσιων πάρκων, την προστασία κρίσιμων ενεργειακών υποδομών, όπως τα FSRU και οι γεωτρήσεις, καθώς και την πόντιση και φύλαξη υποθαλάσσιων καλωδίων